聚类分析软件绿色版是一款非常好用的物品等位基因频率分析工具，该软件功能强大，如物品杂合度，信息含量等等进行分析计算，还可以将计算截图以图形的方式展现出来，让用户能够更好的进行研究分析。聚类分析软件这款软件能够计算分析的内容也是非常的多，如欧氏距离，多态性，遗传距离，聚类计算等等，非常方便。有需要的朋友赶紧来下载这款软件吧。

聚类分析软件最新版这款软件操作方式简单，没有任何难度，再加上可视化的功能栏，用户可以轻松找到需要的功能按键并进行使用。

聚类分析软件功能介绍

1、定义矩阵

定义数据矩阵的大小，用“长×宽”表示，X轴方向为品种，Y轴为数据；分类数（位点数）只在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入，系统默认值为“1”。如输入“5”ד4”“2”，即表示有5个品种，4行数据，2个基因位点。系统最多支持255个品种，9999条数据。

2、输入数据

按定义的矩阵创建一个空白矩阵，若没有定义矩阵大小，则按当前矩阵的大小创建空白矩阵。

3、读入数据

将通过“保存矩阵”命令保存到磁盘上的数据读入到系统，系统将自动创建一个大小与之相适应的矩阵，并将全部数据读入。

4、追加数据

在当前矩阵的尾部继续添加一个已保存的数据，主要用于计算遗传距离。

5、读入遗传距离

将保存到磁盘上的遗传距离数据读入，可直接用于聚类计算。

6、数据正规化

将当前矩阵中的数据按“标准差标准化法”进行处理。注意：点此命令后，在计算遗传距离和进行聚类计算都会使用经过处理后的数据。只有在重新读入或查看原始数据后才会恢复原始数据，再进行遗传距离和聚类计算就会按照原始数据进行计算。

7、计算杂合度

按照Nei氏公式（1974）计算出各品种的杂合度。

8、计算多态性

按照Nei氏公式（1974）计算出各品种的多态信息含量。

9、计算欧氏距离

在将各数据读入到系统后，可用此命令按照Roger公式计算出各品种之间的遗传距离。注：如未在“定义矩阵”中定义分类数（等位基因数），则系统默认其值为1。在此情况下计算得出的遗传距离与使用Mahalanobis公式计算的遗传距离是一样的。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

10、计算遗传距离

在将各数据读入到系统后，可用此命令按照Nei氏公式（1983）计算出各品种之间的遗传距离。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

11、进行聚类计算

在已计算或读入遗传距离后，可用此命令按P.H.A.Sneath等（1973）的类平均聚类法（UPGMA法，又称非加权算术平均数成对聚类法）进行系统聚类。聚类结果说明：第1列No为序列号，代表是第几次聚类；第2列D为距离系数；第3、4列breed1、breed2为参于聚类的两个品种，第5列Cluster为聚类后的新名称，第6列Content为两品种的名称。未注册用户最后3次聚类结果不显示。

12、查看原始数据

将原始数据读入到当前矩阵中。并清除正规化处理过的数据。

13、查看遗传距离

将读入的遗传距离或经过计算得到的遗传距离在当前矩阵中显示。

14、查看聚类图

按照聚类后的结果自动画出聚类图。

15、保存聚类图

将显示的聚类图以图象文件保存到磁盘上。未注册用户无此功能！

16、保存矩阵

将当前矩阵保存到磁盘上。若当前矩阵为原始数据，则保存原始数据；若为经过正规化处理过的数据，则保存经过处理的数据；若为杂合度，则保存杂合度;。。。。。。;若为聚类结果，则保存聚类结果。未注册用户无此功能！

17、数据导出

系统自动判断当前所有矩阵中所含的数据，并将其导出为Excel文件。未注册用户无此功能！

聚类分析软件安装步骤

1、在本站下载聚类分析软件官方版这款软件的压缩包，解压后，双击exe，进入安装界面，点击下一步

2、设置软件安装位置，点击浏览可以修改默认在C盘的安装位置，建议大家选择安装在D盘，然后点击下一步

3、选择持续文件夹，默认即可，点击下一步

4、选择是否创建软件快捷方式，选择是，点击下一步

5、确认软件安装信息，点击下一步

6、聚类分析软件官方版软件正在安装，等待完成即可

聚类分析软件使用方法

1、安装完成点击桌面上的软件打开，界面如图所示。

2、点击定义矩阵，可以在这里控制数据的矩阵，定义数据矩阵的大小，用“长×宽”表示，X轴方向为品种，Y轴为数据；分类数（位点数）只在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入，系统默认值为“1”。如输入“5”ד4”“2”，即表示有5个品种，4行数据，2个基因位点。系统最多支持255个品种，9999条数据。

3、输入数据，将您的分析数据文件导入软件中进行分析，按定义的矩阵创建一个空白矩阵，若没有定义矩阵大小，则按当前矩阵的大小创建空白矩阵。

4、数据正规化，可以将数据自动排版，将当前矩阵中的数据按“标准差标准化法”进行处理。注意：点此命令后，在计算遗传距离和进行聚类计算都会使用经过处理后的数据。只有在重新读入或查看原始数据后才会恢复原始数据，再进行遗传距离和聚类计算就会按照原始数据进行计算。

5、计算命令，您可以通过鼠标点击不同的计算项目进行数据分析，具有计算杂合度、计算多态性、计算欧氏距离、进行聚类计算

6、数据查看及保存命令、查看原始数据、查看遗传距离、保存聚类图、保存矩阵、数据导出

聚类分析软件常见问题

一.如何定义矩阵?

1、运行软件，点击“定义矩阵”

2、设置矩阵大小

3、点击确定即可

二.如何查看聚类分析软件官方版的帮助文件?

在聚类分析软件官方版软件主页点击“帮助”即可快速查看帮助文件